近年來，國內跨境電子商務呈現出迅猛發展態勢。盡管我國的電子商務企業正面臨日益激烈的市場競爭，跨境電子商務還是蘊藏著巨大的 發展潛力，跨境電子商務物流也擁有良好的發展前景，但其發展也并非 一帆風順。 現如今，迅速崛起的跨境電子商務需要克服的阻力主要包括：物流效 率低下、成本難以降低、無法實時追蹤物流狀態、缺乏便利性等問題。不 僅如此，各國環境的不同進一步提高了建設國際物流運輸配送體系的難度。 不同國家、地區的經濟活動都會對跨境物流的發展產生影響。
此外， 文化背景及其他因素也會作用于跨境物流的運營。近幾年，飛機失事頻發， 現代物流渠道在諸多因素的影響下產生波動，導致國際航空貨運的需求增 長十分緩慢，增加了跨境物流運輸體系的建設難度。目前，我國跨境物流 的發展尚處于探索時期，未來，應該將粗放型轉變為集約型，逐步解決跨 境物流在發展過程中存在的問題。 跨境貿易與跨境物流共同構成跨境電子商務，其中，跨境物流涉及本 土物流、國內外海關、國際運輸、末端配送等多個流程的運作。其產業鏈 包含眾多環節，增加了海關通關的難度，也提高了跨境電子商務的風險。 不僅如此，企業還要為跨境物流提供足夠的資金、資源支持。
運營成本是所有企業在發展過程中都不能忽視的因素，企業運營是為 了實現盈利，跨境電子商務物流企業也不例外，其經營者必須對成本問題 進行全面分析。現如今，運營成本居高不下是跨境電子商務物流企業必需要解決的問題之一。 成本過高會給企業發展帶來不利影響。一方面，過高的成本會壓縮企 業的利潤空間，導致企業在競爭中處于劣勢地位；另一方面，成本過高會 阻礙企業的進一步發展，使企業陷入困境。所以，物流企業要想獲得持續 性的發展，就要轉變發展方式，減少運營過程中的成本消耗。 即使專線物流、郵政小包也有可能出現包裹破損、遺失的問題。跨境物流在貨品運輸及配送途中出現這種問題，會降低顧客的整體消費體驗，并增加商家的運營成本，還會導致客戶因對物流服務不滿意而轉向 其他平臺。 除了包裹破損、遺失之外，跨境電子商務還要解決退換貨問題。這類 問題可能發生在跨境物流運營的所有環節中。跨境電子商務在物流環節可 能出現送貨延遲、產品質量達不到預期、貨品損壞、遺失、配送地址不準 確、海關扣留等情況，導致退換貨物流的產生。
在海關通關方面，部分跨境電子商務企業不注重了解目的國的海關監管制度，有些目的國對外來商品的審核十分嚴格。此外，匯率問題也會對跨境電子商務產生影響。幣值的變化會導致稅率波動，可能導致跨境電子商務企業的利潤空間被壓縮。
